Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms