Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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NR1H3Q13133 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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NR1H3Q13133 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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