Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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