Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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