Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP4Q13107 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP4Q13107 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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USP4Q13107 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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USP4Q13107 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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USP4Q13107 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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USP4Q13107 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP4Q13107 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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