Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GPS1Q13098 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms