Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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TRAF1Q13077 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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TRAF1Q13077 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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TRAF1Q13077 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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TRAF1Q13077 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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TRAF1Q13077 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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TRAF1Q13077 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF1Q13077 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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