Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms