Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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HOXD10P28358 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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HOXD10P28358 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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