Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LRRTM2O43300 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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