Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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RABGEF1Q9UJ41 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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RABGEF1Q9UJ41 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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RABGEF1Q9UJ41 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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RABGEF1Q9UJ41 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1Q9UJ41 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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