Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LTBP3Q9NS15 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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LTBP3Q9NS15 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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LTBP3Q9NS15 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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LTBP3Q9NS15 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LTBP3Q9NS15 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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