Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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