Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TMX3Q96JJ7 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms