Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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