Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RTL8BQ17RB0 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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RTL8BQ17RB0 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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RTL8BQ17RB0 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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