Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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