Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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DDB1Q16531 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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