Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms