Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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