Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHD4Q14839 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms