Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ERV3-1Q14264 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms