Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCINQ13939 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms