Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GTF2H2Q13888 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GTF2H2Q13888 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms