Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms