Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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