Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SP140Q13342 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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