Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RIGQ13278 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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RIGQ13278 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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RIGQ13278 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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RIGQ13278 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RIGQ13278 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RIGQ13278 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RIGQ13278 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RIGQ13278 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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