Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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