Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms