Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms