Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1AQ13111 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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