Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFX1Q12986 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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