Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXC1Q12948 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXC1Q12948 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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