Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPREP23469 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPREP23469 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPREP23469 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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