Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms