Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LRRTM2O43300 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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