Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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