Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ATG3Q9NT62 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms