Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TM6SF1Q9BZW5 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms