Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD8Q96LT4 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms