Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
CFAP47Q6ZTR5 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CFAP47Q6ZTR5 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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