Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms