Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms