Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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