Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CTF1Q16619 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTF1Q16619 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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