Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms