Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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