Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms