Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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